MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methylobacterium sp. 4-46 plasmid pM44602

Total Repeats: 387

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010374	GCG	2	6	31	36	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010374	GGA	2	6	158	163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169825393
3	NC_010374	CGC	2	6	209	214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825393
4	NC_010374	GC	3	6	239	244	0 %	0 %	50 %	50 %	169825393
5	NC_010374	AAT	2	6	330	335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169825393
6	NC_010374	CGA	2	6	362	367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825393
7	NC_010374	G	6	6	368	373	0 %	0 %	100 %	0 %	169825393
8	NC_010374	GCG	2	6	419	424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825393
9	NC_010374	TGCCG	2	10	486	495	0 %	20 %	40 %	40 %	169825393
10	NC_010374	CGA	2	6	535	540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825393
11	NC_010374	TCGC	2	8	560	567	0 %	25 %	25 %	50 %	169825393
12	NC_010374	GGA	2	6	581	586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169825393
13	NC_010374	CTG	2	6	630	635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825393
14	NC_010374	AGC	2	6	651	656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825393
15	NC_010374	AGC	2	6	673	678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825393
16	NC_010374	CTG	2	6	783	788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825393
17	NC_010374	GGA	2	6	917	922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010374	AGC	2	6	954	959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825394
19	NC_010374	CGT	2	6	971	976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825394
20	NC_010374	CAT	2	6	1028	1033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825394
21	NC_010374	CGAC	2	8	1090	1097	25 %	0 %	25 %	50 %	169825394
22	NC_010374	TGG	2	6	1127	1132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825394
23	NC_010374	TTA	2	6	1213	1218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825394
24	NC_010374	GGCG	2	8	1227	1234	0 %	0 %	75 %	25 %	169825394
25	NC_010374	GCC	2	6	1254	1259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825394
26	NC_010374	ACCT	2	8	1275	1282	25 %	25 %	0 %	50 %	169825394
27	NC_010374	TCG	2	6	1339	1344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825394
28	NC_010374	TCA	2	6	1387	1392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825394
29	NC_010374	GC	3	6	1404	1409	0 %	0 %	50 %	50 %	169825394
30	NC_010374	GGC	2	6	1427	1432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825394
31	NC_010374	GTTC	2	8	1463	1470	0 %	50 %	25 %	25 %	169825394
32	NC_010374	GCT	2	6	1473	1478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825394
33	NC_010374	CGC	2	6	1505	1510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825394
34	NC_010374	CTGAG	2	10	1531	1540	20 %	20 %	40 %	20 %	169825394
35	NC_010374	GAG	2	6	1563	1568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169825394
36	NC_010374	TTCA	2	8	1701	1708	25 %	50 %	0 %	25 %	169825395
37	NC_010374	GAG	2	6	1740	1745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169825395
38	NC_010374	GCA	2	6	1763	1768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825395
39	NC_010374	GCA	2	6	1908	1913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010374	GTC	2	6	2030	2035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010374	CGATGG	2	12	2095	2106	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	169825396
42	NC_010374	CG	3	6	2165	2170	0 %	0 %	50 %	50 %	169825396
43	NC_010374	GCG	2	6	2182	2187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825396
44	NC_010374	TCGC	2	8	2200	2207	0 %	25 %	25 %	50 %	169825396
45	NC_010374	CCG	2	6	2224	2229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825396
46	NC_010374	CGC	2	6	2238	2243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825396
47	NC_010374	GTCA	2	8	2308	2315	25 %	25 %	25 %	25 %	169825397
48	NC_010374	GCC	2	6	2369	2374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825397
49	NC_010374	GCC	2	6	2389	2394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_010374	GC	3	6	2427	2432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010374	CT	3	6	2445	2450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_010374	GCG	2	6	2576	2581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825398
53	NC_010374	GAGC	2	8	2654	2661	25 %	0 %	50 %	25 %	169825398
54	NC_010374	GGC	2	6	2775	2780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825398
55	NC_010374	AGGCC	2	10	2807	2816	20 %	0 %	40 %	40 %	169825398
56	NC_010374	CTC	2	6	2820	2825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169825398
57	NC_010374	CGGC	2	8	2844	2851	0 %	0 %	50 %	50 %	169825398
58	NC_010374	CTC	2	6	2862	2867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169825398
59	NC_010374	CGT	2	6	2975	2980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825398
60	NC_010374	CGAT	2	8	2998	3005	25 %	25 %	25 %	25 %	169825398
61	NC_010374	GCC	2	6	3073	3078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_010374	C	6	6	3125	3130	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
63	NC_010374	CGC	2	6	3150	3155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_010374	GCG	2	6	3180	3185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010374	CGG	2	6	3189	3194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010374	GGC	2	6	3200	3205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010374	CCTGC	2	10	3218	3227	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
68	NC_010374	GATC	2	8	3272	3279	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_010374	CGA	2	6	3379	3384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010374	CGC	2	6	3397	3402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_010374	CGG	2	6	3405	3410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010374	GCG	3	9	3467	3475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010374	CGG	2	6	3497	3502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010374	CGG	2	6	3579	3584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825399
75	NC_010374	GCGA	2	8	3592	3599	25 %	0 %	50 %	25 %	169825399
76	NC_010374	GC	3	6	3638	3643	0 %	0 %	50 %	50 %	169825399
77	NC_010374	GAG	2	6	3644	3649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169825399
78	NC_010374	GCT	2	6	3673	3678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825399
79	NC_010374	TCG	2	6	3693	3698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825399
80	NC_010374	CTAT	2	8	3857	3864	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_010374	AGG	2	6	3867	3872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010374	GCG	2	6	3907	3912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010374	TAAC	2	8	3915	3922	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_010374	A	6	6	4053	4058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010374	GTTT	2	8	4085	4092	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010374	GC	4	8	4111	4118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_010374	T	6	6	4151	4156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010374	GGT	2	6	4199	4204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825400
89	NC_010374	TGC	3	9	4228	4236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825400
90	NC_010374	GC	4	8	4254	4261	0 %	0 %	50 %	50 %	169825400
91	NC_010374	AG	3	6	4278	4283	50 %	0 %	50 %	0 %	169825400
92	NC_010374	CG	3	6	4355	4360	0 %	0 %	50 %	50 %	169825400
93	NC_010374	CGCT	2	8	4363	4370	0 %	25 %	25 %	50 %	169825400
94	NC_010374	GCG	2	6	4376	4381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825400
95	NC_010374	CGGC	2	8	4393	4400	0 %	0 %	50 %	50 %	169825400
96	NC_010374	CGG	2	6	4427	4432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825400
97	NC_010374	GCG	2	6	4442	4447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825400
98	NC_010374	AC	3	6	4558	4563	50 %	0 %	0 %	50 %	169825401
99	NC_010374	AAG	2	6	4589	4594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825401
100	NC_010374	AT	3	6	4600	4605	50 %	50 %	0 %	0 %	169825401
101	NC_010374	A	7	7	4615	4621	100 %	0 %	0 %	0 %	169825401
102	NC_010374	TAGATA	2	12	4715	4726	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	169825401
103	NC_010374	TAT	2	6	4800	4805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169825401
104	NC_010374	AGA	2	6	4812	4817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825401
105	NC_010374	TG	3	6	4860	4865	0 %	50 %	50 %	0 %	169825401
106	NC_010374	AT	3	6	4875	4880	50 %	50 %	0 %	0 %	169825401
107	NC_010374	ACG	2	6	4916	4921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825401
108	NC_010374	GGC	2	6	4926	4931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825401
109	NC_010374	TTG	2	6	4973	4978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169825401
110	NC_010374	AGT	2	6	4987	4992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825401
111	NC_010374	AAG	2	6	5007	5012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825401
112	NC_010374	AGA	2	6	5110	5115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825401
113	NC_010374	TG	3	6	5153	5158	0 %	50 %	50 %	0 %	169825401
114	NC_010374	TGG	2	6	5224	5229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825401
115	NC_010374	CAT	2	6	5253	5258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169825401
116	NC_010374	CCAA	2	8	5284	5291	50 %	0 %	0 %	50 %	169825401
117	NC_010374	CAG	2	6	5325	5330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169825401
118	NC_010374	TCAAA	2	10	5364	5373	60 %	20 %	0 %	20 %	169825401
119	NC_010374	AGA	2	6	5388	5393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825401
120	NC_010374	GAA	2	6	5479	5484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169825401
121	NC_010374	TGA	2	6	5550	5555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825401
122	NC_010374	GAG	2	6	5632	5637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169825401
123	NC_010374	ACC	2	6	5707	5712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_010374	CTG	2	6	5720	5725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_010374	TGGC	2	8	5742	5749	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_010374	TGA	2	6	5821	5826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825402
127	NC_010374	CTG	2	6	5859	5864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825402
128	NC_010374	TCG	2	6	5887	5892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169825402
129	NC_010374	TC	3	6	5894	5899	0 %	50 %	0 %	50 %	169825402
130	NC_010374	GCC	2	6	5939	5944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825402
131	NC_010374	TC	3	6	6016	6021	0 %	50 %	0 %	50 %	169825402
132	NC_010374	G	6	6	6029	6034	0 %	0 %	100 %	0 %	169825402
133	NC_010374	GC	3	6	6097	6102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_010374	CAC	3	9	6170	6178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_010374	TGG	3	9	6184	6192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010374	TGG	2	6	6458	6463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169825403
137	NC_010374	CCT	2	6	6553	6558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169825403
138	NC_010374	CTC	2	6	6602	6607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169825403
139	NC_010374	TCGA	2	8	6674	6681	25 %	25 %	25 %	25 %	169825403
140	NC_010374	CGG	2	6	6749	6754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	169825404
141	NC_010374	GCC	2	6	6800	6805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825404
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144	NC_010374	AGT	2	6	7016	7021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169825404
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146	NC_010374	AAGTGG	2	12	7289	7300	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	169825405
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161	NC_010374	GCC	2	6	7800	7805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169825405
162	NC_010374	CCT	2	6	7822	7827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169825405
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261	NC_010374	CGGC	2	8	12263	12270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
262	NC_010374	GCCG	2	8	12280	12287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
263	NC_010374	AGCA	2	8	12541	12548	50 %	0 %	25 %	25 %	169825409
264	NC_010374	GTCG	2	8	12580	12587	0 %	25 %	50 %	25 %	169825409
265	NC_010374	GCTC	2	8	12642	12649	0 %	25 %	25 %	50 %	169825409
266	NC_010374	CG	3	6	12733	12738	0 %	0 %	50 %	50 %	169825409
267	NC_010374	CTC	3	9	12772	12780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169825409
268	NC_010374	CTC	2	6	12793	12798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169825409
269	NC_010374	CCAT	2	8	12862	12869	25 %	25 %	0 %	50 %	169825409
270	NC_010374	AATC	2	8	12922	12929	50 %	25 %	0 %	25 %	169825409
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272	NC_010374	ACA	2	6	12968	12973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169825409
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275	NC_010374	GTTTA	2	10	13093	13102	20 %	60 %	20 %	0 %	169825409
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386	NC_010374	C	8	8	19964	19971	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
387	NC_010374	GA	3	6	20010	20015	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.